Neste artigo apresentamos os diferentes paradigmas científicos e a sua relação com as Ciências da Saúde, considerando diferentes concepções de saúde e cuidado e formatos de pesquisa científica. Em particular, abordamos as práticas integrativas e complementares e a sua potencialidade de incluir a autoconsciência nas pesquisas, a partir da compreensão de diferentes racionalidades médicas, da individualização do cuidado e da dimensão energética. Por fim, analisamos dificuldades e potencialidades para realizar pesquisas sobre práticas integrativas e complementares, explicitando sua aproximação com a pesquisa Conscienciológica, e discutindo ferramentas que podem favorecer o estudo da autoconsciência.